一种计算分子动力学动态时间步长的方法

专利类型：发明专利 

语 言：中文 

申 请 号：CN201210340172.4 

申 请 日：20120914 

发 明 人：解辉刘朝 

申 请 人：重庆大学 

申请人地址：400044 重庆市沙坪坝区沙坪坝正街174号 

公 开 日：20151118 

公 开 号：CN102867125B 

代 理 人：赵荣之 

代理机构：北京同恒源知识产权代理有限公司 11275 

摘　　要：一种计算分子动力学动态时间步长的方法，具体计算步骤如下：1）计算每两个分子之间的距离???????????????????????????????????????????????，判断数组的数值是否都大于截断半径r_c；2）计算每两个分子之间的相对速度；3）计算每两个分子之间运动到截断半径所需要的时间t(n)；4）在数组t(n)中取出最小值t_min作为下一步的时间步长。本发明的动态分子动力学模拟算法可以消除无效的计算步骤，加快了计算速度，节省了计算时间，使分子动力学模拟非聚集状态，扩展了分子动力学模拟的应用范围。 

主 权 项：一种计算分子动力学动态时间步长的方法，包括有多个分子，其特征在于，具体计算步骤如下：1)测量所有分子的坐标，计算每两个分子之间的距离l_ij，i和j为分子编号，判断数组l_ij的数值是否都大于截断半径r_c，若大于则转入步骤2)，若小于则结束；2)测量所有分子的运动速度，计算每两个分子之间的相对速度v_ij；3)根据步骤1)和步骤2)中所测得的每两个分子之间的距离l_ij和速度v_ij，计算每两个分子之间运动到截断半径所需要的时间t(n)，t_ij＝(l_ij?r_c)/v_ijt(n)为由t_ij组成的数组；4)在数组t(n)中取出最小值t_min作为下一步的时间步长。 

关 键 词： 

法律状态：授权 

IPC专利分类号：G06F19/00(2011.01)I