基于基因表达谱的肿瘤基因识别方法
专利类型：发明专利
语 言：中文
申 请 号：CN201110032012.9
申 请 日：20110128
申 请 人：重庆大学
申请人地址：400044 重庆市沙坪坝区沙正街174号
公 开 日：20110525
公 开 号：CN102073799A
代 理 人：张先芸
代理机构：重庆博凯知识产权代理有限公司 50212
摘 要：本发明提供一种基于基因表达谱的肿瘤基因识别方法，通过计算机辅助手段，融合局部保持投影和核函数-最近邻分类方法，采用局部保持投影方法对基因样本的基因表达矩阵进行学习，将其投影到低维嵌入空间，可以揭示隐藏在高维基因表达谱数据中的低维流形结构，然后利用核函数-最近邻分类方法对低维特征矩阵进行分类，使低维特征矩阵中没有显现的特征突现出来，进而划分出基因样本中的肿瘤基因，实现了肿瘤基因的识别。本发明方法具有较高的识别率，对于肿瘤基因的临床诊断具有很好的参考价值，可应用于建立肿瘤基因识别系统。
主 权 项：1.基于基因表达谱的肿瘤基因识别方法，其特征在于，将基因样本的基因表达谱以计算机可识别的格式输入计算机，利用计算机进行分类，划分出其中的肿瘤基因；该方法具体包括如下步骤：1)根据先验知识获取与待测基因样本种类相同的M个正常基因样本和M个肿瘤基因样本，该种类基因样本的基因表达谱特征数为N；将所述M个正常基因样本和M个肿瘤基因样本的基因表达谱输入计算机，由每个基因样本的基因表达谱生成一个维数为N的向量，向量的第n维数据值代表基因样本的第n个基因表达谱特征，n∈{1，2，...，N}；从而，由所述M个正常基因样本生成正常基因表达矩阵Z正＝{z′1，z′2，…，z′m，…，z′M}，由所述M个肿瘤基因样本生成肿瘤基因表达矩阵Z肿＝{z″1，z″2，…，z″m，…，z″M 关 键 词： 法律状态：生效 IPC专利分类号：G06F19/24